แม้ว่าคอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมและคอนโทรลเลอร์กลางจะมีความคล้ายคลึงกันมาก แต่ก็ยังมีความแตกต่างบางประการ:

การใช้งานที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักใช้สำหรับการควบคุมอัตโนมัติ การรวบรวมและประมวลผลข้อมูลในระบบควบคุมอุตสาหกรรม ในขณะที่คอนโทรลเลอร์กลางมักใช้สำหรับระบบควบคุมกลางของอาคารขนาดใหญ่หรือบ้านอัจฉริยะ โดยรับผิดชอบในการควบคุมการทำงานของอุปกรณ์หรือระบบทั้งหมด

ความสามารถในการประมวลผลที่แตกต่างกัน: เนื่องจากต้องประมวลผลข้อมูลแบบเรียลไทม์ คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมจึงต้องการความสามารถในการประมวลผลที่สูงขึ้นและความเร็วในการตอบสนองที่เร็วขึ้น ในขณะที่คอนโทรลเลอร์กลางมักไม่จำเป็นต้องประมวลผลข้อมูลจำนวนมากและการควบคุมแบบเรียลไทม์ ดังนั้นความสามารถในการประมวลผลจึงค่อนข้างต่ำ

ความสามารถในการขยายที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักมีความสามารถในการขยายที่แข็งแกร่งกว่า และสามารถเพิ่มสล็อต อินเทอร์เฟซ และโมดูลได้ตามต้องการ ในขณะที่คอนโทรลเลอร์กลางมักจะค่อนข้างคงที่ มีความสามารถในการขยายที่จำกัด และแทบไม่มีโอกาสในการอัปเกรด

สภาพแวดล้อมการทำงานที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมมักใช้ในสภาพแวดล้อมอุตสาหกรรมที่รุนแรง ซึ่งต้องการความทนทานและความน่าเชื่อถือที่สูงขึ้น ในขณะที่คอนโทรลเลอร์กลางมักใช้ในสภาพแวดล้อมที่เสถียร เช่น บ้านหรือสำนักงาน

การกำหนดค่าฮาร์ดแวร์ที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักมีข้อกำหนดการกำหนดค่าฮาร์ดแวร์ที่เข้มงวดกว่า โดยต้องการคุณสมบัติ เช่น การทนทานต่อการรบกวนทางแม่เหล็กไฟฟ้า การป้องกันฝุ่น การกันน้ำ และการทนทานต่อแรงกระแทก ในขณะที่คอนโทรลเลอร์กลางมักไม่ต้องการคุณสมบัติเหล่านี้