แม้ว่าคอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมและเครื่องควบคุมกลางจะคล้ายกันมาก แต่ยังมีความแตกต่างบางอย่าง

การใช้งานที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักจะใช้ในการควบคุมอัตโนมัติและการเก็บข้อมูลและการประมวลผลในระบบควบคุมอุตสาหกรรมเครื่องควบคุมกลางมักจะใช้สําหรับระบบควบคุมกลางของอาคารขนาดใหญ่หรือบ้านฉลาดหน้าที่ควบคุมการทํางานของอุปกรณ์หรือระบบทั้งหมด

ความสามารถในการประมวลผลที่แตกต่างกัน: เนื่องจากความจําเป็นในการประมวลผลข้อมูลในเวลาจริง คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมต้องการความสามารถในการประมวลผลที่สูงขึ้นและความเร็วการตอบสนองที่เร็วขึ้นตัวควบคุมกลางมักไม่จําเป็นต้องประมวลผลข้อมูลจํานวนมากและควบคุมในเวลาจริงและความสามารถในการแปรรูปของมันค่อนข้างต่ํา

ความสามารถขยายที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักมีความสามารถขยายที่แข็งแกร่งกว่าและสามารถเพิ่มสล็อต, อินเตอร์เฟซ และโมดูลมากขึ้นตามความต้องการ; เครื่องควบคุมกลางมักคงอยู่,มีความสามารถในการปรับขนาดที่ต่ํา และมีโอกาสที่จะปรับปรุงได้น้อย

สภาพแวดล้อมการทํางานที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมมักจะใช้ในสภาพแวดล้อมอุตสาหกรรมที่รุนแรงที่ต้องการความทนทานและความน่าเชื่อถือสูงกว่าขณะที่เครื่องควบคุมกลางถูกใช้ในสภาพแวดล้อมที่มั่นคง เช่น บ้านหรือสํานักงาน.

การตั้งค่าฮาร์ดแวร์ที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมอุตสาหกรรมมักมีความต้องการในการตั้งค่าฮาร์ดแวร์ที่เข้มงวดกว่าการป้องกันฝุ่น, กันน้ําและกันกระแทก; อย่างไรก็ตาม เครื่องควบคุมกลางมักไม่ต้องการคุณสมบัติเหล่านี้